Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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