Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SYT9Q86SS6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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SYT9Q86SS6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SYT9Q86SS6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SYT9Q86SS6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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