Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
WDR53Q7Z5U6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms