Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP31Q70CQ4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms