Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms