Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms