Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms