Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPF38BQ5VTL8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms