Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LDLRAP1Q5SW96 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms