Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM3Q53FZ2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms