Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP21-3Q3LHN1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms