Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF8Q3BBV2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms