Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSPP1Q1MSJ5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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