Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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