Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT16Q17RD7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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