Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms