Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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