Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TWIST1Q15672 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms