Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SS18Q15532 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SS18Q15532 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SS18Q15532 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SS18Q15532 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SS18Q15532 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SS18Q15532 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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