Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PDCD1Q15116 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PDCD1Q15116 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PDCD1Q15116 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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