Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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