Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms