Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTCH1Q13635 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
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