Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CUL4AQ13619 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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CUL4AQ13619 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CUL4AQ13619 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CUL4AQ13619 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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