Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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