Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CHAF1BQ13112 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CHAF1BQ13112 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHAF1BQ13112 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms