Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRIM32Q13049 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM32Q13049 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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