Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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