Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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