Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms