Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC8Q09428 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms