Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP27A1Q02318 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms