Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1DQ01668 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms