Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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