Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms