Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HBBP68871 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms