Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RPS29P62273 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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