Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA1P59665 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms