Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRG3P56975 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRG3P56975 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NRG3P56975 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NRG3P56975 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NRG3P56975 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NRG3P56975 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NRG3P56975 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms