Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA2D1P54289 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms