Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMARCA2P51531 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMARCA2P51531 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms