Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms