Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms