Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NESP48681 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NESP48681 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NESP48681 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NESP48681 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NESP48681 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NESP48681 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms