Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRATP43155 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CRATP43155 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRATP43155 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRATP43155 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms