Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTR1BP42025 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACTR1BP42025 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms