Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDH1P40925 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MDH1P40925 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MDH1P40925 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDH1P40925 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms