Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms