Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5C1P36542 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms