Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD27P26842 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD27P26842 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CD27P26842 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD27P26842 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD27P26842 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD27P26842 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD27P26842 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD27P26842 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD27P26842 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD27P26842 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms